Instytut Studiów Europejskich w ramach współpracy z otoczeniem zewnętrznym realizuje swoją misję edukacyjną nie tylko ze studentami, ale również z uczniami szkół średnich. W zeszłym roku ISE objął patronatem klasy z dwóch liceów krakowskich i jednego z Dębicy. Angażuje się w życie społeczności tych szkół oraz kształcenie i kształtowanie ich wychowanków.